Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HRCT1Q6UXD1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms