Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms