Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN4Q56A73 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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