Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms