Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA2Q15822 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms