Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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NR1H3Q13133 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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NR1H3Q13133 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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