Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERFP50548 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms