Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms