Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms