Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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