Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NL46 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms