Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms