Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB1Q9Y478 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms