Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SF3B6Q9Y3B4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SF3B6Q9Y3B4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms