Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SSUH2Q9Y2M2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms