Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC4Q9Y296 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms