Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNFSF13BQ9Y275 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF13BQ9Y275 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms