Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MED13Q9UHV7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED13Q9UHV7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms