Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf48Q9UBA6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C6orf48Q9UBA6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms