Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHMP5Q9NZZ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1911.1 ms