Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC45.02■■■■■ 4.8
BICRAQ9NZM4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
BICRAQ9NZM4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
BICRAQ9NZM4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
BICRAQ9NZM4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
BICRAQ9NZM4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
BICRAQ9NZM4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
BICRAQ9NZM4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC45■■■■■ 4.79
BICRAQ9NZM4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC44.99■■■■■ 4.79
BICRAQ9NZM4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
BICRAQ9NZM4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC44.99■■■■■ 4.79
BICRAQ9NZM4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
BICRAQ9NZM4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
BICRAQ9NZM4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
BICRAQ9NZM4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
BICRAQ9NZM4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
BICRAQ9NZM4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
BICRAQ9NZM4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
BICRAQ9NZM4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
BICRAQ9NZM4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
BICRAQ9NZM4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.79
BICRAQ9NZM4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC44.89■■■■■ 4.78
BICRAQ9NZM4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC44.88■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC44.86■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC44.85■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC44.85■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
BICRAQ9NZM4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.81■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC44.81■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC44.77■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC44.77■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC44.76■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
BICRAQ9NZM4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC44.75■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC44.74■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
BICRAQ9NZM4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms