Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GGA3Q9NZ52 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GGA3Q9NZ52 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GGA3Q9NZ52 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms