Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDND1Q9NY35 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms