Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD4Q9NVD3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD4Q9NVD3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms