Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCMTD2Q9NV79 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms