Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39AQ9NV64 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM39AQ9NV64 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms