Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS00

C1GALT1, Glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1GALT1Q9NS00 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1GALT1Q9NS00 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms