Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEC31BQ9NQW1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC31BQ9NQW1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SEC31BQ9NQW1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms