Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH12Q9NPG4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDH12Q9NPG4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms