Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD248Q9HCU0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms