Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EBF2Q9HAK2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms