Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPS7BQ9H9Q2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms