Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX17Q9H6I2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX17Q9H6I2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms