Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFIH1Q9BYX4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFIH1Q9BYX4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFIH1Q9BYX4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms