Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP8

PAPPA2, Pappalysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA2Q9BXP8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PAPPA2Q9BXP8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAPPA2Q9BXP8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPPA2Q9BXP8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 382.2 ms