Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPPED1Q9BRF8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPPED1Q9BRF8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms