Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK3Q9BQ16 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK3Q9BQ16 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK3Q9BQ16 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCK3Q9BQ16 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCK3Q9BQ16 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCK3Q9BQ16 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCK3Q9BQ16 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCK3Q9BQ16 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCK3Q9BQ16 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCK3Q9BQ16 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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