Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID3AQ99856 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms