Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSMD1Q99460 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSMD1Q99460 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms