Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
DEPDC7Q96QD5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
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