Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP5Q96PP8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP5Q96PP8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms