Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKNOX2Q96KN3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms