Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW9

TAMM41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAMM41Q96BW9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAMM41Q96BW9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAMM41Q96BW9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAMM41Q96BW9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms