Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GTPBP3Q969Y2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms