Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRUQ92729 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRUQ92729 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRUQ92729 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms