Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCSTNQ92542 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms