Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIN3Q8TB24 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIN3Q8TB24 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms