Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDX1

PSD4, PH and SEC7 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD4Q8NDX1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD4Q8NDX1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD4Q8NDX1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD4Q8NDX1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD4Q8NDX1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD4Q8NDX1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD4Q8NDX1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD4Q8NDX1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD4Q8NDX1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD4Q8NDX1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD4Q8NDX1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD4Q8NDX1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD4Q8NDX1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD4Q8NDX1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms