Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NINQ8N4C6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINQ8N4C6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms