Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY84

NIM1K, Serine/threonine-protein kinase NIM1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIM1KQ8IY84 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NIM1KQ8IY84 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NIM1KQ8IY84 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms